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畜禽粪便是农业生产中理想的有机高效肥，适量施用可以改良土壤 ，培养地力 ，防止土质下降 。然而直接施用可能会造成环境污染、农产品品质下降 。对于人口稠密的城镇 、工厂 、学校等周边地区，集约化的规模养殖场畜禽排出大量粪尿若不经处理不仅会造成环境严重污染 ，还容易引起疾病传播。
随着我国农业生产的发展 ，农业有机废弃物数量急剧增长，使得有机废弃物大量堆积 ，养分流失 ，污染环境。有机肥是最有效的消纳有机废弃物资源的手段 。目前，有机废弃物好养发酵方式应用较普遍的通常有四种：即平地堆置法、发酵槽发酵法、塔式发酵法与滚筒发酵法 。
1 、平地堆置发酵法。在发酵棚中将调配好的原料堆成2米宽 、1.5米高的长垄 ，每天翻1～2次 ，35～60天腐熟 。此种形式的特点是投资较少，操作简单 。
2、发酵槽发酵法。发酵槽为砖混结构 ，槽长度30～40米 、宽6～8米 、深2米左右 ，可以若干个槽并列组合，置于封闭或半封闭的发酵房中 。发酵房顶棚采用透光材料，以充分利用太阳能 。发酵槽底部埋设通气管 ，物料填入后采用高压送风装置定时强制通风 ，以保持槽内通气良好，促进微生物迅速繁殖。采用铲车或专用发酵翻堆设备定期翻动 ，一般每天翻动1～2次 。经过30天左右发酵 ，温度由最高时的70～80℃逐步下降趋于稳定，物料就腐熟了 。
3、塔式发酵法。发酵塔为矩形塔 ，内部为分层结构 ，层数可根据需要设定，上下通风透气 、体积可大可小 ，可多个塔组合 。有机废弃物被提升到塔的顶层 ，通过自动翻板定时翻动，物料随之落到下层 。按照设定的发酵时间发酵物料逐层落到底层 ，发酵过程结束。塔式发酵采用钢质翻板 ，长期浸泡在含有腐蚀性物质的有机废物中，易腐蚀生锈，发酵塔的寿命会受到影响。
4 、滚筒式发酵法 。发酵滚筒为钢结构 ，并设有驱动装置 ，安装成与地面倾斜1.5～3°的角度，采用皮带输送机将畜禽粪便送入滚筒 ，滚筒定时旋转 ，一方面使物料在翻动中补充氧气，另一方面 ，因为滚筒是倾斜的 ，在滚筒转动过程中，物料由进料端缓慢向出料端移动 。当物料移出滚筒时 ，物料已经腐熟。
由于好氧发酵有一些条件的限制：如含水率：45%～60%;环境温度：15℃以上;碳氮比：25/1～35/1 。因此无论采用哪种堆肥方法 ，都必须掌握以下几个步骤：
1、水分调节
水分为微生物生长所必需，在堆肥过程中 ，按重量计算50～60%的含水率最有利于微生物分解 。畜禽粪便的含水率一般在75～80% ，一般采用含水率比较低的秸秆进行调节。
2 、控制发酵温度
有机物料正常发酵的重要条件之一是适宜的温度 。在气候寒冷的地区，为了保证发酵过程正常进行，需采用加温保温措施 。目前比较经济可行的办法是利用太阳能对物料加温与保温 ，可利用温室大棚的原理设计发酵设施。发酵设施应采用透光性能好 、结实耐用的PVC或玻璃钢等屋面材料与墙体材料 。发酵设施冬天应封闭良好 ，具有良好的保温性能;同时应通风方便，以提供物料发酵所需要的氧气 。
3、调节碳氮比
通常畜禽粪便的碳氮比是低于20:1的 ，而秸秆的碳氮比高于50:1 ，那么发酵物料的碳氮比调整到25～35:1的话，可以在畜禽粪便中添加一部分秸秆 ，一方面调节碳氮比 ，另一方面由于秸秆含水率低还可起到调节物料含水率的作用。
4 、翻堆
通气性是影响堆肥温度和发酵效果的重要因素 。翻堆的目的是改善堆内通气条件，散发水分 ，促进高温有益微生物的繁殖 ，使堆温达到60～70℃，加速发酵物料的转化 ，从而达到混合均匀 、受热一致、腐熟一致 。可采用人工翻堆 ，也可采用轮式翻堆机、装载机 、深槽好氧翻堆机等机械来翻动物料。在发酵过程中，每天翻动1～2次比较适宜。
5 、筛分
为了提高有机肥料产品的商品价值，便于包装贮存 ，一般采取筛分工艺分选出大块物料 。筛分设备有圆筒筛、振动筛等不同类型 ，如果为了减少投资，也可采用人工筛分的办法 ，筛上物集中填埋或作为发酵辅料回用 ，筛下物可作为有机肥料产品 。
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